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我國(guó)科學(xué)家獲得首個(gè)染色體級(jí)別橡膠樹(shù)參考基因組圖譜

2019-12-19 09:25:51    焦宏

由云南省熱帶作物科學(xué)研究所特聘研究員、中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所研究員、熱帶作物種質(zhì)資源與基因組學(xué)云南省創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)首席科學(xué)家高立志教授帶領(lǐng)的云南省熱帶作物科學(xué)研究所、中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所和華南農(nóng)業(yè)大學(xué)基因組學(xué)與生物信息學(xué)研究中心的聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì),歷經(jīng)6年,在國(guó)際上首次獲得了達(dá)到染色體級(jí)別的高質(zhì)量巴西橡膠樹(shù)優(yōu)良品種GT1的參考基因組序列,并揭示大戟植物基因組的染色體進(jìn)化、膠乳生物合成與橡膠樹(shù)的馴化。該研究為橡膠樹(shù)的高產(chǎn)、抗病、抗旱、抗寒等重要經(jīng)濟(jì)性狀的基因組選擇育種與優(yōu)異基因資源的發(fā)掘利用提供了染色體級(jí)別的高質(zhì)量橡膠樹(shù)參考基因組圖譜。

論文第一作者、云南省熱帶作物科學(xué)研究所柳覲研究員介紹,與以前發(fā)表的基因組草圖比較基因組學(xué)分析表明,該研究獲得的基因組圖譜在組裝準(zhǔn)確性與完整性上都得到了極大的提升;將組裝獲得的約1.47Gb的基因組序列掛載到了18條假染色體上;研究進(jìn)一步證實(shí),在木薯屬與橡膠屬分化之前二者共同的祖先里發(fā)生過(guò)古多倍化事件;通過(guò)染色體水平上的比較基因組學(xué)分析首次構(gòu)建了大戟植物的染色體演化模型。

據(jù)介紹,巴西橡膠樹(shù)這一重要參考基因組的獲得、膠乳生物合成代謝通路的解析、栽培和野生橡膠樹(shù)基因組變異精準(zhǔn)圖譜的構(gòu)建以及栽培橡膠樹(shù)馴化的認(rèn)識(shí),對(duì)我國(guó)未來(lái)橡膠優(yōu)異種質(zhì)資源的保護(hù)、發(fā)掘與育種利用具有重要的戰(zhàn)略意義。

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