2020-08-05 10:56:25
記者日前從中國農(nóng)業(yè)科學院油料作物研究所獲悉,該所油料作物基因組學與抗病性改良創(chuàng)新團隊成功破譯了油菜基因組的全轉(zhuǎn)錄信息密碼,構(gòu)建了油菜10萬余個基因的轉(zhuǎn)錄全景圖,使得油菜功能基因研究第一次有了相對標準的可參考的基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫,為相關(guān)研究提供了有力支撐。該項研究成果日前在線發(fā)表在國際知名期刊《The Plant Journal》上。
據(jù)參與該項研究的相關(guān)科研人員介紹,油菜基因組包含約12億個堿基和10萬余個基因,如何解讀這些海量的基因組信息成為功能基因研究的重要任務(wù)。根據(jù)分子生物學的中心法則,基因通過轉(zhuǎn)錄形成mRNA(信使核糖核酸)再翻譯成蛋白質(zhì)。由于基因的轉(zhuǎn)錄通常存在多種可變的剪切方式,一個基因可以形成許多種不同的mRNA。此前,由于技術(shù)和資源的限制,油菜一直缺乏全基因組水平所有基因的轉(zhuǎn)錄mRNA數(shù)據(jù)庫,導(dǎo)致油菜功能基因研究缺乏可查詢和可參考的基因注釋信息。
為了突破這一瓶頸,中國農(nóng)業(yè)科學院油料作物研究所油料作物基因組學與抗病性改良創(chuàng)新團隊采用最新的三代測序技術(shù)準確測定了油菜全長轉(zhuǎn)錄組,并自主開發(fā)了一套用于多倍體油菜復(fù)雜基因組的分型方法,成功繪制了油菜基因組的轉(zhuǎn)錄全景圖,構(gòu)建了油菜基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫。該研究成果更新了人們對油菜基因和基因組的認識和理解,將為甘藍型油菜功能基因和遺傳改良研究,及基因組設(shè)計育種提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)和理論指導(dǎo)。作者:侯文坤