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山東省農(nóng)科院等單位聯(lián)合破譯德州驢基因組

2020-12-21 16:35:06   

日前,由山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院與東阿阿膠股份有限公司主導(dǎo),聯(lián)合國內(nèi)外多家單位共同合作的“德州驢基因組開發(fā)及其產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用”項(xiàng)目傳來捷報(bào),該項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)已獲得國際首個(gè)組裝到染色體水平的家驢基因組參考圖譜,研究成果于12月9日在Nature子刊《Nature Communications》在線發(fā)表,為馬屬動物遺傳資源保護(hù)和利用及家驢基因組育種和遺傳改良提供了重要理論支撐。

驢產(chǎn)業(yè)是我國畜牧業(yè)中的特色產(chǎn)業(yè),在世界上具有領(lǐng)先優(yōu)勢。作為名貴中藥材“阿膠”的重要原料供體,驢其不僅是畜牧業(yè)中的重要一員,也是醫(yī)療康養(yǎng)界的“明星”。作為阿膠產(chǎn)業(yè)核心省份的山東,為深入挖掘優(yōu)良品種“德州驢”的遺傳資源,進(jìn)一步提升遺傳資源利用水平,山東省農(nóng)科院聯(lián)合東阿阿膠股份有限公司,于2014年底聯(lián)合發(fā)起了“德州驢基因組開發(fā)及其產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用”項(xiàng)目,經(jīng)過5年多的不懈攻關(guān),最終成功構(gòu)建了德州驢染色體水平的高質(zhì)量參考基因組圖譜。該參考基因組用到了二代測序(Hiseq sequencing)、三代測序(PacBio sequencing)和染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)(Hi-C),其Scaffold N50達(dá)到93.37 Mb,是目前奇蹄目馬屬動物中連續(xù)性最好的參考基因組。

我國大型優(yōu)良驢品種多為深毛色,小型驢品種及野驢多為淺毛色,其背后的分子機(jī)制對于培育優(yōu)良驢品種具有重要意義。德州驢作為深毛色優(yōu)良率品種,其基因組不僅為馬屬動物的起源進(jìn)化研究提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ),也為優(yōu)良遺傳資源保護(hù)和利用、家驢基因組選擇育種和遺傳改良、家驢分子設(shè)計(jì)育種提供數(shù)據(jù)支撐。作者:張偉 呂兵兵

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