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首次構(gòu)建反芻動物氫代謝微生物基因組數(shù)據(jù)庫

2021-07-26 10:57:15   

長期以來,科學(xué)家重點(diǎn)關(guān)注反芻動物瘤胃微生物的菌群組成和功能,而全消化道微生物對飼料利用效率、甲烷生成和宿主健康的功能解析尚未完成。近日,中科院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所(以下簡稱亞熱帶生態(tài)所)、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)等單位聯(lián)合開展了反芻動物全消化道微生物組的結(jié)構(gòu)和功能研究。相關(guān)研究成果發(fā)表于《微生物組》。

研究人員選取了奶牛、水牛、牦牛、山羊、綿羊、狍子和獐子7種代表性反芻動物,采集了瘤胃、小腸等全消化道10個(gè)區(qū)段的食糜樣品共370個(gè),構(gòu)建了反芻動物全消化道微生物基因集,組裝了超過10000個(gè)非冗余的微生物基因組,且在種水平上鑒定出了8745個(gè)新基因組。專家認(rèn)為,這些新基因組極大地拓展了反芻動物全消化道微生物基因組資源,在分類學(xué)上大幅提升了對反芻動物消化道微生物的分辨率。

同時(shí),研究團(tuán)隊(duì)對組裝微生物基因組的氫酶分布進(jìn)行了系統(tǒng)解析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),反芻動物消化道中約60%的微生物編碼氫酶基因能夠進(jìn)行氫代謝。這些微生物分布在24個(gè)門、72個(gè)目和304個(gè)屬中。其中,約50%微生物基因組能通過發(fā)酵途徑產(chǎn)生氫分子,有95個(gè)甲烷菌基因組能利用氫生成甲烷,其他消耗氫微生物有352個(gè)。

“該研究首次構(gòu)建了反芻動物氫代謝微生物基因組數(shù)據(jù)庫,證實(shí)了全消化道微生物具有廣泛代謝氫的能力,這將為提高飼料利用效率和減少甲烷排放提供科技支撐。”亞熱帶生態(tài)所研究員王敏告訴《中國科學(xué)報(bào)》。(見習(xí)記者李昕茹)

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