2023-03-28 09:02:33
近日，記者在寧夏召開的“枸杞功能基因組學(xué)研究與應(yīng)用”項目工作推進(jìn)會上獲悉，針對枸杞高度雜合、基因組復(fù)雜等特點(diǎn)，該項目已獲取大量枸杞序列資源，開發(fā)出專門的分析流程，組裝出枸杞參考基因組，鑒定了大量結(jié)構(gòu)變異，構(gòu)建了枸杞的變異組圖譜。目前，項目組正在開展枸杞圖形化泛基因組圖譜構(gòu)建工作。
據(jù)悉，“枸杞功能基因組學(xué)研究與應(yīng)用”項目是寧夏科技廳2022年7月正式啟動實施的首批4個“揭榜掛帥”科技項目中的一項，旨在解決寧夏枸杞產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展中的“卡脖子”技術(shù)。該項目由國家枸杞工程技術(shù)研究中心牽頭，寧夏農(nóng)林科學(xué)院枸杞科學(xué)研究所所長曹有龍課題組聯(lián)合西北農(nóng)林科技大學(xué)、四川大學(xué)、北京林業(yè)大學(xué)等單位共同實施。項目將針對枸杞參考基因組遺傳信息偏少、功能基因研究滯后、品種選育周期長等問題，選取10份代表枸杞材料，構(gòu)建泛基因組數(shù)據(jù)庫。
圍繞枸杞產(chǎn)業(yè)發(fā)展和智能設(shè)計育種的重大戰(zhàn)略需求，項目組聚焦枸杞基因組信息偏少、重大有育種價值基因發(fā)掘不足、品種選育周期長等瓶頸問題，在前期枸杞種質(zhì)精準(zhǔn)鑒定和遺傳多樣性分析基礎(chǔ)上，選取了14份代表枸杞種質(zhì)材料，利用最新測序技術(shù)進(jìn)行高通量測序，獲得了超過5Tb的數(shù)據(jù)，獲得了大量枸杞序列資源，構(gòu)建了枸杞的變異組圖譜。
在此基礎(chǔ)上，項目組已初步建立起枸杞的高效遺傳轉(zhuǎn)化體系，轉(zhuǎn)化效率達(dá)到50%。同時，項目組首次將基因編輯技術(shù)應(yīng)用到枸杞種質(zhì)創(chuàng)制中，對枸杞的3個棘刺基因進(jìn)行了編輯，單靶點(diǎn)編輯效率達(dá)60%，雙靶點(diǎn)編輯效率17%，成功獲得基因編輯植株。該技術(shù)將加速枸杞品種的遺傳改良，加快枸杞的分子育種進(jìn)程。
“下一步，我們將對枸杞重大功能基因的挖掘應(yīng)用開展研究，支撐我們枸杞產(chǎn)業(yè)在資源和種質(zhì)創(chuàng)新方面有大突破，同時定向培育更多藥用、大果型枸杞新品種，滿足枸杞產(chǎn)業(yè)發(fā)展的需求，支撐枸杞產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展?！表椖拷M相關(guān)負(fù)責(zé)人表示。
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