2024-09-29 21:53:04
家牛的祖先—原牛，曾廣泛分布在整個歐亞大陸和非洲北部，包括普通原牛、瘤原牛和非洲原牛等亞種。原牛已于400年前滅絕。9月26日，西北農(nóng)林科技大學(xué)雷初朝教授團隊首次揭示已滅絕東亞原牛的演化歷史及其對東亞家牛的遺傳貢獻的成果——《東亞原牛的演化與遺傳貢獻》，以長文形式在《科學(xué)通報》雜志在線發(fā)表并將以封面論文正式刊出。
我國東北松嫩平原東亞原牛骨架與張氏中華原牛復(fù)原圖
遺傳學(xué)、考古學(xué)證據(jù)表明，我國北方地區(qū)曾廣泛分布東亞原牛，考古遺址豐富的東北松花江流域曾出土大量人類和動物化石，但由于缺乏支持石器存在的考古學(xué)證據(jù)及可靠的年代測定數(shù)據(jù)，關(guān)于該流域的動物和人類演化情況知之甚少。
早在2013年，云南大學(xué)張虎才教授和西農(nóng)雷初朝教授合作，在《自然通訊》發(fā)表了題為 “形態(tài)和遺傳學(xué)證據(jù)證實中國東北存在全新世牛類動物”的論文，首次證實距今10600年前中國東北地區(qū)存在東亞原牛。
為了解析10600年前中國東北地區(qū)全新世的原牛與世界其他原牛亞種的演化關(guān)系，雷初朝教授團隊、張虎才教授團隊和中國科學(xué)院昆明動物研究所張曉明研究員團隊合作，對中國東北地區(qū)59個牛亞科動物遺骸進行碳-14測年，并構(gòu)建了東北地區(qū)牛屬動物距今約4.3萬年至3600年的時間序列。
東亞原牛獨特的遺傳結(jié)構(gòu)及其對東亞家牛的遺傳貢獻（A）樣本采集的地理位置與年代范圍；（B）線粒體基因組的系統(tǒng)發(fā)育樹；（C）核基因組的系統(tǒng)發(fā)育樹；（D）qpGraph遺傳混合模型分析；（E）f3共享等位基因分析。
基于時間分布，該研究選擇其中19個松花江流域的牛亞科動物樣本（約4.3萬年至3600年前）及一個至少可追溯到6400年前青藏高原的樣本開展遺傳學(xué)分析。通過線粒體基因組和核基因組分析，鑒定出其中16個樣本為東亞原牛，3個樣本為草原野牛，并且首次揭示東亞原牛與歐洲原牛、西亞原牛和非洲原牛基因組遺傳分化明顯，并把這16個東亞原牛命名為一個新的原牛亞種，B. p. sinensis Zhang（張氏中華原牛）。同時利用全球古代、現(xiàn)代家牛的基因組數(shù)據(jù)進行聯(lián)合分析，結(jié)果表明，東亞原牛從4000年前便對東亞早期家牛和現(xiàn)代家牛有持續(xù)性的基因組貢獻。盡管東亞原牛已經(jīng)滅絕，但其在東亞家?；蚪M上留下了深深的印記。
西北農(nóng)林科技大學(xué)已畢業(yè)博士侯佳雯（現(xiàn)為中國科學(xué)院昆明動物研究所博士后）、博士生管西雯、博士后夏小婷和已畢業(yè)博士呂陽（現(xiàn)為吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)副教授）為并列第一作者，云南大學(xué)張虎才教授、西北農(nóng)林科技大學(xué)雷初朝教授和陳寧博副教授以及中國科學(xué)院昆明動物研究所張曉明研究員為論文的共同通訊作者。該研究得到國家自然科學(xué)基金和國家肉牛牦牛產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系等多個項目的支持，西北農(nóng)林科技大學(xué)高性能計算平臺為該項目提供了運算資源。（李曉春）
論文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.scib.2024.09.016
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